金石斛和石斛是有不同之处的，比如其两者的分属不同、形态特征不同、花期不同等。
从植物学上来说，金石斛和石斛都是属于兰科，但是金石斛是属于金石斛属;而石斛是属于石斛属。从形态特征上来说，金石斛很接近木质，其是有很多分枝的，最为明显的特征就是上端一个节间有一个膨大成粗厚的假鳞茎;而石斛是很少有分枝的。
金石斛和石斛的叶片、花朵和花期也是不同的，金石斛属于叶一枚;而石斛属于叶一至多枚。金石斛的花比较小，单生或2至3朵成簇;而石斛则是生于茎的中部或以上，花的形态是多样的，有大有小。金石斛的花期很短，一般半天就会凋谢;而石斛的花期很长，一般为一周以上。
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