来源不同
木薯粉：木薯粉是由一种与橡胶同属的槭科植物的块茎经过干制加工成的粉制品，其淀粉含量较高，很多地方称为木薯淀粉。
红薯粉：红薯粉也就是地瓜粉，其来源于我们常见的地瓜，地瓜是薯类植物的一种，这种粉也含有较高的淀粉，属于粗粮的一种。
用途不同
木薯粉：在我国木薯粉主要是用来做饲料和食物的添加剂，在我国台湾地区常用木薯粉制作芋圆，具有很Q的口感。
红薯粉：红薯粉主要是用来制作粉条的，当然也有制作饲料，其制作的粉条也有一定的弹性，口感比米粉好，香味不如米粉。
成份不同
木薯粉：木薯粉除了含有大量的淀粉之外，还含有一种毒素——亚麻仁苦苷，这种成分在食用之后会在胃酸的作用下分家产生氢氰酸，这种酸随人体有毒害作用。
红薯粉：红薯粉没有任何毒素，主要成分是淀粉，在食用之后会使人有一种饱腹感，容易产气，不适合大量食用。
木薯粉能用红薯粉代替吗?
1.木薯粉主要是用来制作食物的添加剂，补充食物中的淀粉，使食物具有弹性，在这方面红薯粉也能有这个效果，是可以替代的。
2.台湾芋圆的主要成分之一就是木薯粉，运用不仅仅是木薯淀粉的弹性，还需要木薯淀粉在经过蒸熟之后的晶莹剔透的纯洁感，而红薯粉在经过蒸熟之后颜色是灰色，没有木薯粉的亮泽，不能替换。
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