南京中医药大学是一所以中医药学科为主，兼有其他学科的综合性大学，其研究生院是学校的重要组成部分。
研究生院的主要职能是负责研究生的招生、培养、管理和就业工作，以及研究生教育的科学研究和管理工作。研究生院设有研究生招生办公室、研究生教育管理办公室、研究生就业指导中心、研究生科研管理办公室、研究生学术交流办公室、研究生学术活动办公室、研究生学习资源中心等部门。
研究生院积极推进研究生教育改革，推行研究生课程改革，推行研究生学分制，推行研究生综合考试，推行研究生质量工程，推行研究生科研管理制度，推行研究生学术交流活动，推行研究生就业指导，推行研究生学习资源服务等，以提高研究生教育质量。
研究生院还设有研究生会，负责组织研究生参加学术交流活动，组织研究生参加社会实践活动，组织研究生参加文体活动，组织研究生参加科技竞赛，组织研究生参加社会服务活动，组织研究生参加学术研究，组织研究生参加就业指导等活动，以及组织研究生参加学校组织的各类活动。
研究生院积极推动研究生教育改革，不断提高研究生教育质量，为学校的发展做出了重要贡献。研究生院将继续努力，为学校的发展做出更大的贡献。
作为一所以中医药学科为主，兼有其他学科的综合性大学，南京中医药大学的研究生院在招生、培养、管理和就业工作，以及研究生教育的科学研究和管理工作方面发挥着重要作用。研究生院不断推进研究生教育改革，推行研究生课程改革、研究生学分制、研究生综合考试、研究生质量工程、研究生科研管理制度、研究生学术交流活动、研究生就业指导、研究生学习资源服务等，为学校的发展做出了重要贡献。
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