福建中医药大学研究生部是学校的重要组成部分，负责研究生的招生、培养、管理和服务工作。
福建中医药大学研究生部致力于建设一流的研究生教育体系，积极推进研究生教育改革，提高研究生教育质量，努力培养具有创新精神和实践能力的高素质研究生。
福建中医药大学研究生部设有研究生招生办公室、研究生教育管理办公室、研究生就业指导中心、研究生科研管理办公室、研究生学术交流办公室等，为研究生提供全方位的服务。
研究生招生办公室负责研究生招生工作，组织实施研究生招生考试，组织实施研究生招生宣传，指导研究生招生工作，组织实施研究生招生录取工作，组织实施研究生招生结果公示等。
研究生教育管理办公室负责研究生教育管理工作，负责研究生教育政策的制定、实施和检查，负责研究生教育管理制度的制定、实施和检查，负责研究生教育管理信息系统的建设、实施和检查，负责研究生教育管理工作的组织、协调和指导等。
研究生就业指导中心负责研究生就业指导工作，负责研究生就业指导政策的制定、实施和检查，负责研究生就业指导服务的组织、实施和检查，负责研究生就业指导信息系统的建设、实施和检查，负责研究生就业指导工作的组织、协调和指导等。
研究生科研管理办公室负责研究生科研管理工作，负责研究生科研政策的制定、实施和检查，负责研究生科研管理制度的制定、实施和检查，负责研究生科研管理信息系统的建设、实施和检查，负责研究生科研管理工作的组织、协调和指导等。
研究生学术交流办公室负责研究生学术交流工作，负责研究生学术交流政策的制定、实施和检查，负责研究生学术交流服务的组织、实施和检查，负责研究生学术交流信息系统的建设、实施和检查，负责研究生学术交流工作的组织、协调和指导等。
福建中医药大学研究生部以全新的管理理念，以优质的服务，以完善的制度，以严格的管理，以完善的服务，为研究生提供全方位的服务，努力培养具有创新精神和实践能力的高素质研究生，为学校的发展做出贡献。
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